Кишеч­ная мик­ро­би­о­та пред­став­ля­ет собой слож­ную эко­си­сте­му, вклю­ча­ю­щую трил­ли­о­ны мик­ро­ор­га­низ­мов, кото­рые ока­зы­ва­ют суще­ствен­ное вли­я­ние на физио­ло­гию чело­ве­ка. Соглас­но совре­мен­ным иссле­до­ва­ни­ям, состав бак­те­ри­аль­ных сооб­ществ желу­доч­но-кишеч­но­го трак­та вза­и­мо­свя­зан с про­цес­са­ми мета­бо­лиз­ма, иммун­ной регу­ля­ции и пред­рас­по­ло­жен­но­стью к ряду забо­ле­ва­ний. Одним из клю­че­вых инстру­мен­тов систе­ма­ти­за­ции этих дан­ных высту­па­ет кон­цеп­ция энте­ро­ти­пов — устой­чи­вых кла­сте­ров бак­те­ри­аль­ных сооб­ществ, раз­ли­ча­ю­щих­ся по доми­ни­ру­ю­щим таксонам.

Пер­во­на­чаль­но были пред­ло­же­ны три основ­ных энте­ро­ти­па: с пре­об­ла­да­ни­ем бак­те­рий рода Bacteroides, Prevotella и Ruminococcus. Одна­ко резуль­та­ты круп­но­мас­штаб­ных когорт­ных иссле­до­ва­ний послед­них лет демон­стри­ру­ют необ­хо­ди­мость более деталь­ной стра­ти­фи­ка­ции. В част­но­сти, япон­ское иссле­до­ва­ние, опуб­ли­ко­ван­ное в 2025 году в жур­на­ле Gut Pathogens, выяви­ло четы­ре кла­сте­ра с после­ду­ю­щим уточ­не­ни­ем до семи под­ти­пов, что поз­во­ли­ло иден­ти­фи­ци­ро­вать ранее не опи­сан­ные кон­фи­гу­ра­ции мик­ро­био­ты, ассо­ци­и­ро­ван­ные с повы­шен­ным мета­бо­ли­че­ским риском.

Энтеротип Bacteroides

Бак­те­ри­аль­ный тип наи­бо­лее харак­те­рен для лиц, при­дер­жи­ва­ю­щих­ся запад­ной моде­ли пита­ния, кото­рая пред­по­ла­га­ет высо­кое потреб­ле­ние мяса, рыбы, яиц, сыра и низ­кое содер­жа­ние клет­чат­ки в раци­оне. Дан­ный энте­ро­тип отли­ча­ет­ся высо­кой саха­ро­ли­ти­че­ской актив­но­стью и спо­соб­но­стью эффек­тив­но рас­щеп­лять бел­ки и жиры. С поло­жи­тель­ной сто­ро­ны бак­те­ри­аль­ный тип обес­пе­чи­ва­ет син­тез ряда вита­ми­нов, вклю­чая вита­мин C, B2, B5 и био­тин. Кро­ме того, пред­ста­ви­те­ли дан­но­го энте­ро­ти­па участ­ву­ют в подав­ле­нии роста пато­ген­ных мик­ро­ор­га­низ­мов и про­дук­ции корот­ко­це­по­чеч­ных жир­ных кис­лот, под­дер­жи­ва­ю­щих энер­ге­ти­че­ский баланс кле­ток кишеч­но­го эпи­те­лия. Одна­ко при избы­точ­ном поступ­ле­нии живот­но­го бел­ка бак­те­ри­аль­ный тип может уси­ли­вать вос­па­ли­тель­ные про­цес­сы и уве­ли­чи­вать нагруз­ку на печень. Спо­соб­ность пере­ра­ба­ты­вать рас­ти­тель­ную клет­чат­ку у дан­но­го энте­ро­ти­па выра­же­на сла­бее, что сни­жа­ет общее раз­но­об­ра­зие микробиоты.

С точ­ки зре­ния дина­ми­ки веса бак­те­ри­аль­ный энте­ро­тип харак­те­ри­зу­ет­ся быст­рым усво­е­ни­ем кало­рий из бел­ко­вой и жиро­вой пищи. Пере­еда­ние про­дук­тов живот­но­го про­ис­хож­де­ния ведет к накоп­ле­нию жиро­вой мас­сы. При пере­хо­де на сба­лан­си­ро­ван­ный раци­он с добав­ле­ни­ем ово­щей и клет­чат­ки сни­же­ние веса про­ис­хо­дит лег­че. Бак­те­ри­аль­ный энте­ро­тип ассо­ци­и­ро­ван с повы­шен­ным риском мета­бо­ли­че­ско­го син­дро­ма, ожи­ре­ния, повы­шен­но­го уров­ня холе­сте­ри­на, а так­же забо­ле­ва­ний пече­ни и кишеч­ни­ка. Соглас­но резуль­та­там япон­ско­го когорт­но­го иссле­до­ва­ния, под­тип Bacteroides 2 (B2) свя­зан со сни­жен­ным аль­фа-раз­но­об­ра­зи­ем мик­ро­био­ты и повы­шен­ным риском мета­бо­ли­че­ских забо­ле­ва­ний, в част­но­сти ожи­ре­ния (отно­ше­ние шан­сов OR = 1,51) и арте­ри­аль­ной гипер­тен­зии (OR = 1,49).

Энтеротип Prevotella

(пре­во­тел­ла-тип)

Пре­во­тел­ла-тип типи­чен для лиц с рас­ти­тель­ным раци­о­ном, вклю­ча­ю­щим зна­чи­тель­ное коли­че­ство ово­щей, фрук­тов, зла­ков и клет­чат­ки. Дан­ный энте­ро­тип эффек­тив­но рас­щеп­ля­ет угле­во­ды и рас­ти­тель­ные волок­на, а так­же участ­ву­ет в обра­зо­ва­нии вита­ми­нов груп­пы B, в част­но­сти B1 и фоли­е­вой кис­ло­ты. К поло­жи­тель­ным свой­ствам пре­во­тел­ла-типа отно­сит­ся про­дук­ция полез­ных мета­бо­ли­тов из рас­ти­тель­ной пищи. Вме­сте с тем при избыт­ке угле­во­дов пред­ста­ви­те­ли дан­но­го энте­ро­ти­па могут раз­ру­шать защит­ный слой сли­зи­стой обо­лоч­ки кишеч­ни­ка. Они обра­зу­ют про­те­а­зу, раз­ру­ша­ю­щую имму­но­гло­бу­лин A (IgA) — белок иммун­ной защи­ты сли­зи­стых обо­ло­чек. При дис­ба­лан­се мик­ро­био­ты это может повы­шать риск вос­па­ли­тель­ных про­цес­сов и язвообразования.

Пре­во­тел­ла-тип скло­нен к коле­ба­ни­ям уров­ня глю­ко­зы: избы­точ­ное потреб­ле­ние угле­во­дов вызы­ва­ет быст­рый подъ­ем инсу­ли­на и накоп­ле­ние жиро­вой мас­сы. Огра­ни­че­ние быст­рых угле­во­дов, нор­ма­ли­за­ция гли­ке­мии и добав­ле­ние бел­ка в раци­он поло­жи­тель­но ска­зы­ва­ют­ся на дина­ми­ке веса. Дан­ный энте­ро­тип ассо­ци­и­ро­ван с вос­па­ли­тель­ны­ми забо­ле­ва­ни­я­ми желу­доч­но-кишеч­но­го трак­та (в осо­бен­но­сти язвен­ной болез­нью и эро­зи­я­ми), нару­ше­ни­ем барьер­ной функ­ции сли­зи­стой обо­лоч­ки и син­дро­мом раз­дра­жен­но­го кишечника.

Энтеротипы кишечной микробиоты

Совре­мен­ные иссле­до­ва­ния выяви­ли новый под­тип Prevotella 2 (P2), харак­те­ри­зу­ю­щий­ся почти дву­крат­ным повы­ше­ни­ем рис­ка ожи­ре­ния и сахар­но­го диа­бе­та. Под­ти­пы B2 и P2 отли­ча­ют­ся сни­жен­ным содер­жа­ни­ем бак­те­рий — про­ду­цен­тов корот­ко­це­по­чеч­ных жир­ных кис­лот и обо­га­ще­ни­ем услов­но-пато­ген­ны­ми микроорганизмами.

Энтеротип Ruminococcus

(руми­но­кок­ко­вый тип)

Руми­но­кок­ко­вый тип встре­ча­ет­ся у лиц со сба­лан­си­ро­ван­ным пита­ни­ем, вклю­ча­ю­щим уме­рен­ное коли­че­ство бел­ка и клет­чат­ки. Он часто выяв­ля­ет­ся у тех, кто потреб­ля­ет цель­ные про­дук­ты и огра­ни­чи­ва­ет обра­бо­тан­ные угле­во­ды. Поло­жи­тель­ные свой­ства руми­но­кок­ко­во­го типа вклю­ча­ют рас­щеп­ле­ние клет­чат­ки с обра­зо­ва­ни­ем мас­ля­ной кис­ло­ты (бути­ра­та) — мощ­но­го про­ти­во­вос­па­ли­тель­но­го ком­по­нен­та. Дан­ный энте­ро­тип под­дер­жи­ва­ет иммун­ную и барьер­ную функ­ции кишеч­ни­ка, а так­же син­те­зи­ру­ет вита­ми­ны B1 и фоли­е­вую кис­ло­ту. При нару­ше­нии балан­са руми­но­кок­ко­вый тип может спо­соб­ство­вать избы­точ­но­му усво­е­нию саха­ров. Он чув­стви­те­лен к стрес­су и дли­тель­ным нару­ше­ни­ям пита­ния, осо­бен­но к голоданию.

Набор веса при руми­но­кок­ко­вом типе про­ис­хо­дит при избыт­ке слад­ко­го и пере­ра­бо­тан­ных угле­во­дов. Сни­же­ние веса эффек­тив­но дости­га­ет­ся при дие­те с низ­кой гли­ке­ми­че­ской нагруз­кой, высо­ким содер­жа­ни­ем клет­чат­ки, про­био­ти­ков и пре­био­ти­ков. Руми­но­кок­ко­вый энте­ро­тип ассо­ци­и­ро­ван с риском сахар­но­го диа­бе­та 2 типа, сни­же­ни­ем чув­стви­тель­но­сти кле­ток к инсу­ли­ну, хро­ни­че­ски­ми вос­па­ле­ни­я­ми и нару­ше­ни­я­ми обме­на веществ.

Современные данные

О стра­ти­фи­ка­ции энтеротипов

Резуль­та­ты круп­но­мас­штаб­но­го япон­ско­го когорт­но­го иссле­до­ва­ния, опуб­ли­ко­ван­ные в 2025 году, суще­ствен­но рас­ши­ря­ют пред­став­ле­ния о струк­тур­ной орга­ни­за­ции кишеч­ной мик­ро­био­ты. Исполь­зо­ва­ние секве­ни­ро­ва­ния гена 16S рибо­со­маль­ной РНК (16S rRNA) поз­во­ли­ло выявить четы­ре энте­ро­ти­па с после­ду­ю­щей дета­ли­за­ци­ей до семи под­ти­пов. Ана­лиз мета­бо­ли­че­ских сетей вза­и­мо­дей­ствия мик­ро­ор­га­низ­мов пока­зал, что под­ти­пы R1, R2 и P1 демон­стри­ру­ют коопе­ра­тив­ную про­дук­цию корот­ко­це­по­чеч­ных жир­ных кис­лот и дру­гих мета­бо­ли­тов, тогда как бак­те­ри­аль­ные энте­ро­ти­пы про­яв­ля­ют синер­гизм в обра­зо­ва­нии ряда сахар­ных соеди­не­ний. Эти дан­ные под­чер­ки­ва­ют важ­ность уточ­нен­ной кла­сте­ри­за­ции для выяв­ле­ния ранее не рас­по­знан­ных пат­тер­нов мик­ро­био­ты, свя­зан­ных с мета­бо­ли­че­ским риском. Сле­ду­ет отме­тить, что кон­цеп­ция энте­ро­ти­пов не пред­по­ла­га­ет стро­гой дис­крет­но­сти: речь идет о мето­де стра­ти­фи­ка­ции, сни­жа­ю­щем слож­ность мик­роб­ных сооб­ществ для целей кли­ни­че­ской интерпретации.

Методы определения энтеротипа

Лабо­ра­тор­ная диа­гно­сти­ка пред­по­ла­га­ет ана­лиз соста­ва мик­ро­био­ты кишеч­ни­ка по образ­цу кала с при­ме­не­ни­ем мето­дов мета­ге­ном­но­го секве­ни­ро­ва­ния или ана­ли­за гена 16S rRNA. Мета­ге­ном­ное секве­ни­ро­ва­ние обес­пе­чи­ва­ет более пол­ную харак­те­ри­сти­ку все­го дез­ок­си­ри­бо­ну­кле­и­но­во­го ком­плек­са (ДНК) в образ­це и поз­во­ля­ет достичь так­со­но­ми­че­ско­го раз­ре­ше­ния до уров­ня штам­ма, а так­же полу­чить деталь­ную инфор­ма­цию о функ­ци­о­наль­ном потен­ци­а­ле мик­ро­био­ты. Одна­ко отсут­ствие стан­дар­ти­за­ции в сбо­ре и обра­бот­ке образ­цов, тех­но­ло­ги­ях секве­ни­ро­ва­ния и интер­пре­та­ции дан­ных огра­ни­чи­ва­ет сопо­ста­ви­мость резуль­та­тов меж­ду лабо­ра­то­ри­я­ми и их внед­ре­ние в кли­ни­че­скую прак­ти­ку. Ана­лиз гена 16S rRNA (16S rRNA) пред­став­ля­ет собой более доступ­ный метод, обес­пе­чи­ва­ю­щий так­со­но­ми­че­ские про­фи­ли про­ка­ри­о­ти­че­ских орга­низ­мов. Тем не менее его раз­ре­ша­ю­щая спо­соб­ность огра­ни­че­на, что может при­во­дить к вари­а­бель­но­сти резуль­та­тов при иссле­до­ва­нии функ­ци­о­наль­ной актив­но­сти микробиоты.

Кон­цеп­ция энте­ро­ти­пов пред­став­ля­ет собой раз­ви­ва­ю­щий­ся инстру­мент стра­ти­фи­ка­ции кишеч­ной мик­ро­био­ты, поз­во­ля­ю­щий систе­ма­ти­зи­ро­вать дан­ные о вза­и­мо­свя­зи соста­ва бак­те­ри­аль­ных сооб­ществ с мета­бо­ли­че­ским ста­ту­сом чело­ве­ка. Тра­ди­ци­он­ное деле­ние на три основ­ных энте­ро­ти­па (Bacteroides, Prevotella, Ruminococcus) допол­ня­ет­ся совре­мен­ны­ми дан­ны­ми о суще­ство­ва­нии более деталь­ных под­ти­пов, ассо­ци­и­ро­ван­ных с раз­лич­ны­ми уров­ня­ми мета­бо­ли­че­ско­го риска.

Tags:
,

Похожие посты