Актуальность.
Ось «микробиота — кишечник — мозг» рассматривается как один из механизмов, способных изменять индивидуальную восприимчивость к стрессу, депрессивным и тревожным расстройствам. Кишечные микроорганизмы преобразуют пищевые и эндогенные субстраты в короткоцепочечные жирные кислоты, производные триптофана, аминокислотные метаболиты и вторичные желчные кислоты. Эти соединения взаимодействуют с эпителиальными, иммунными, энтероэндокринными и нервными клетками, изменяя барьерную функцию, системное воспаление, активность гипоталамо-гипофизарно-надпочечниковой оси и нейропластичность. Вместе с тем популярная формула, согласно которой кишечные бактерии непосредственно «управляют настроением», не отражает многофакторную и двунаправленную природу наблюдаемых связей.
Обзор, основан на статье M. Yuan и соавторов 2026 г. с дополнительной проверкой первичных экспериментальных исследований, крупных когорт, систематических обзоров, метаанализов, рандомизированных контролируемых исследований и клинических рекомендаций.
Результаты.
Наиболее обоснованными метаболическими посредниками оси «микробиота — кишечник — мозг» являются короткоцепочечные жирные кислоты, метаболиты триптофан-кинуренинового и индольного путей, а также микробно-модифицированные желчные кислоты. Для пролина и связанных с внеклеточным матриксом механизмов имеются перспективные, но пока ограниченные данные. Причинная роль микробиоты наиболее убедительно продемонстрирована в экспериментах на стерильных животных и при переносе микробных сообществ, однако используемые поведенческие показатели не эквивалентны депрессии человека. Исследования у людей выявляют групповые различия микробного состава и метаболических функций, но универсальный «микробиом депрессии» не установлен. Пробиотические и синбиотические вмешательства могут уменьшать выраженность симптомов, однако результаты характеризуются высокой неоднородностью и вероятным эффектом малых исследований. Наиболее строгое исследование трансплантации фекальной микробиоты не продемонстрировало преимущества по первичной конечной точке ремиссии.
Кишечная микробиота не является самостоятельным центром управления настроением, но способна изменять биологический порог стрессовой уязвимости через метаболические, иммунные, эндокринные и нервные механизмы. Микробиомные вмешательства следует рассматривать как исследовательское или дополнительное направление, а не как замену доказанным методам психотерапии и фармакотерапии. Наиболее перспективной представляется стратификация пациентов по функциональным метаболическим профилям, а не поиск одной бактерии или единого таксономического признака депрессии.
- Микробиота влияет на мозг преимущественно косвенно — через метаболиты, иммунные медиаторы, энтероэндокринные клетки, блуждающий нерв и изменения доступности нейромедиаторных предшественников.
- Наиболее изучены короткоцепочечные жирные кислоты, триптофановые метаболиты и желчные кислоты, но их действие зависит от концентрации, локализации, барьерной функции и физиологического состояния организма.
- Универсального микробного профиля депрессии не выявлено. Между исследованиями имеются значительные различия, связанные с рационом, лекарствами, географией, кишечным транзитом, сопутствующими заболеваниями и лабораторными методами.
- Доклинические данные подтверждают возможность причинного влияния, однако депрессивноподобное поведение животных не тождественно большому депрессивному расстройству человека.
- Пробиотики и синбиотики могут использоваться только как возможное дополнение к стандартному лечению. Эффекты зависят от конкретного штамма и не распространяются автоматически на все препараты данного класса.
- Трансплантация фекальной микробиоты при депрессии остаётся экспериментальным вмешательством: наиболее качественное исследование не подтвердило преимущество по ремиссии.
- AhR — арилуглеводородный рецептор;
- BDNF — мозговой нейротрофический фактор;
- FXR — фарнезоидный X-рецептор;
- GPR — рецептор, сопряжённый с G-белком;
- PXR — прегнан-X-рецептор;
- TGR5 — мембранный рецептор желчных кислот;
- БДР — большое депрессивное расстройство;
- ГАМК — γ-аминомасляная кислота;
- ГГН-ось — гипоталамо-гипофизарно-надпочечниковая ось;
- ГЭБ — гематоэнцефалический барьер;
- КЦЖК — короткоцепочечные жирные кислоты;
- РКИ — рандомизированное контролируемое исследование;
- ТФМ — трансплантация фекальной микробиоты.
Микробиота-кишечник-мозг (ось); Сетевая модель (двунаправленность); Короткоцепочечные жирные кислоты (КЦЖК); Триптофан / Кинуренины; Желчные кислоты; Пролин; Метаболиты; Воспаление / Иммунитет; Блуждающий нерв; Депрессия (БДР); Причинность (vs. корреляция); Клинические вмешательства (пробиотики / ТФМ); Отсутствие валидации (биомаркеров); Гетерогенность (неоднородность); Метаболический посредник.
От причинной метафоры к сетевой модели
Формулировка «настроение зависит от бактерий в кишечнике» отражает важное научное направление, но создаёт впечатление одностороннего причинного управления. Более точной является модель двунаправленной распределённой системы, в которой кишечная микробиота¹ взаимодействует с нервной, эндокринной, иммунной и метаболической регуляцией организма. Микроорганизмы способны изменять вероятность определённых физиологических и поведенческих состояний, но не определяют их независимо от генетики, жизненного опыта, социального окружения, сна, питания, лекарств и соматических заболеваний.
Исходная работа M. Yuan и соавторов была опубликована 19 июля 2026 г. в Translational Psychiatry как обзорная статья, находившаяся на момент проверки в редакционно не завершённой версии. В ней систематизированы данные о короткоцепочечных жирных кислотах, производных триптофана, пролине и желчных кислотах, но отсутствуют признаки формального систематического обзора: зарегистрированный протокол, исчерпывающая поисковая стратегия, схема отбора работ и стандартизованная оценка риска систематической ошибки [1].
Научная значимость темы определяется масштабом психических расстройств. По данным Всемирной организации здравоохранения, депрессией страдают около 332 млн человек, или приблизительно 4% населения мира; заболевание чаще встречается у женщин и является одним из факторов суицидального риска [2]. Депрессия и тревожные расстройства связаны приблизительно с 12 млрд потерянных рабочих дней в год и экономическим ущербом порядка 1 трлн долларов США вследствие снижения производительности [3]. В исследовании глобального бремени болезней психические расстройства отнесены к ведущим причинам жизни с ограничением здоровья [4].
Однако БДР представляет собой синдром, а не единую молекулярную болезнь. Сходная клиническая картина может формироваться при различных сочетаниях наследственной предрасположенности, нарушений сна и циркадных ритмов, ранних неблагоприятных событий, хронического социального стресса, воспаления, метаболической дисфункции и изменений нейронных систем вознаграждения. Микробиота встраивается в эту сеть как один из потенциально модифицируемых факторов.
Анатомия оси «микробиота — кишечник — мозг»
Входные воздействия
Состав и функциональная активность кишечной экосистемы зависят от рациона, лекарств, антибиотиков, возраста, половых гормонов, географии, скорости кишечного транзита, физической активности и сна. Психическое расстройство также изменяет многие из этих факторов. Депрессия может сопровождаться снижением или повышением аппетита, ограничением разнообразия пищи, уменьшением физической активности и нарушением суточного режима. Поэтому микробные изменения способны быть одновременно предпосылкой, посредником и следствием заболевания.
Психотропные препараты представляют собой дополнительный смешивающий фактор. Они могут изменять моторику кишечника, массу тела, пищевое поведение и рост отдельных микроорганизмов. Сравнение пациентов, получающих лекарственное лечение, со здоровыми людьми без соответствующей поправки не позволяет отделить признак заболевания от эффекта терапии.
Микробная биотрансформация
Микроорганизмы ферментируют неперевариваемые углеводы с образованием ацетата, пропионата и бутирата; преобразуют триптофан в индольные соединения; участвуют в обмене пролина, глутамата и ГАМК; деконъюгируют и модифицируют желчные кислоты; изменяют доступность витаминов и лекарств [1, 5].
Один метаболит обычно образуется несколькими видами бактерий, а один микроорганизм способен участвовать в нескольких метаболических цепях. Поэтому функциональное состояние экосистемы нельзя надёжно вывести из относительного содержания одного рода или вида.
Барьерные и сенсорные интерфейсы
Метаболиты взаимодействуют с кишечным эпителием, клетками врождённого и адаптивного иммунитета, энтероэндокринными клетками и энтеральными нейронами. Изменения плотных межклеточных контактов способны влиять на проницаемость кишечника, однако термин «повышенная кишечная проницаемость» не следует использовать как универсальное объяснение неспецифических симптомов без объективных измерений.
Энтероэндокринные клетки могут передавать сигналы вагусным афферентам не только через медленное высвобождение гормонов, но и посредством быстрых синапсоподобных контактов. Работа M.M. Kaelberer и соавторов показала наличие глутаматергической передачи от специализированных кишечных сенсорных клеток к нейронам блуждающего нерва [8]. Это подтверждает принципиальную возможность быстрого сообщения кишечника с мозгом, но не означает, что любой бактериальный метаболит непосредственно активирует такую цепь.
Исторические экспериментальные основания
В 2004 г. N. Sudo и соавторы показали, что у стерильных мышей стресс сопровождался усиленным выбросом адренокортикотропного гормона и кортикостерона, а ранняя микробная колонизация частично нормализовала реакцию ГГН-оси [6]. В 2011 г. J.A. Bravo и соавторы обнаружили, что введение Lactobacillus rhamnosus JB-1 изменяло экспрессию ГАМК-рецепторов и поведение мышей; после ваготомии эффекты исчезали [7]. Эти результаты сформировали экспериментальную основу концепции, но относятся к конкретным моделям, штаммам и условиям содержания животных.
В дальнейшем было показано влияние микробиоты на периферический синтез серотонина [9], проницаемость ГЭБ [23] и созревание микроглии [24]. В каждом случае первичные данные требуют точной локализации эффекта: кишечная продукция серотонина не равнозначна увеличению серотонина мозга, а изменение ГЭБ у стерильных мышей не доказывает аналогичного нарушения у всех пациентов с депрессией.
Короткоцепочечные жирные кислоты
Метаболическая валюта кишечной экосистемы
КЦЖК образуются главным образом при анаэробной ферментации пищевых волокон. Бутират служит важным энергетическим субстратом для колоноцитов, способствует сохранению физиологического кислородного градиента и участвует в регуляции плотных межклеточных контактов. Ацетат и пропионат в большей степени поступают в системный обмен [18, 19].
КЦЖК активируют рецепторы свободных жирных кислот FFAR2 и FFAR3, рецептор HCAR2, а также способны подавлять активность гистондеацетилаз. Через эти механизмы они влияют на экспрессию генов, дифференцировку регуляторных T-клеток, секрецию кишечных гормонов и иммунный тонус. Эксперименты на мышах показали, что бутират и другие КЦЖК участвуют в поддержании колониальных регуляторных T-клеток [21, 22]. Микробиота и её метаболиты также связаны с созреванием микроглии и состоянием ГЭБ [23, 24].
Эти данные не оправдывают линейную формулу «больше бутирата — лучше настроение». Биологический эффект определяется концентрацией, местом образования, скоростью всасывания, состоянием эпителия, доступностью рецепторов и сопутствующей патологией. Физиологическая концентрация в просвете толстой кишки и искусственно созданная системная экспозиция не являются взаимозаменяемыми.
Метаанализ 2026 г. объединил 16 исследований типа «случай — контроль» и шесть РКИ. У пациентов с депрессией были обнаружены более низкие концентрации ацетата, пропионата, бутирата и валерата в плазме: стандартизованные различия средних составили соответственно −0,51, −0,65, −0,43 и −1,09. В то же время для ацетата, пропионата и бутирата не выявлено устойчивого различия в кале. Пробиотические и пребиотические вмешательства увеличивали фекальные концентрации КЦЖК, однако посредническая роль этих изменений в уменьшении депрессивных симптомов не была доказана [20].
Расхождение между плазмой и калом физиологически объяснимо. Концентрация в кале представляет собой остаток после микробной продукции, перекрёстного потребления другими бактериями, всасывания эпителием и разбавления кишечным содержимым. Поэтому однократное определение фекального бутирата не является прямой мерой его суммарного синтеза.
Установлено: КЦЖК участвуют в эпителиальной, иммунной и метаболической регуляции.
Вероятно: нарушение их образования или распределения может изменять восприимчивость к стресс-индуцированному воспалению.
Не доказано: что определение КЦЖК в кале диагностирует депрессию либо что приём бутирата является клинически подтверждённой антидепрессивной терапией.
Триптофановая развилка
Три направления обмена
Триптофан распределяется между синтезом белка, серотониновым и мелатониновым путями, кинурениновым обменом и микробным образованием индольных соединений. Большая часть свободного триптофана, не использованного для синтеза белка, превращается по кинурениновому пути [25].
Ферменты индоламин-2,3-диоксигеназа 1 и триптофан-2,3-диоксигеназа образуют кинуренин. Первый фермент активируется воспалительными сигналами, включая интерферон-γ; второй регулируется, в частности, глюкокортикоидами и доступностью субстрата. Кинуренин способен проходить через ГЭБ и далее метаболизироваться в клетках центральной нервной системы.
Кинурениновая система и нейровоспаление
Кинуренин может направляться к образованию кинуреновой кислоты либо к 3-гидроксикинуренину и хинолиновой кислоте. Хинолиновая кислота при определённых условиях усиливает NMDA-зависимую глутаматергическую передачу и окислительный стресс. Кинуреновая кислота преимущественно ограничивает глутаматергическую активацию, хотя её избыток также способен нарушать когнитивные процессы.
Разделение на «нейротоксическую» и «нейропротективную» ветви является полезной моделью, но не абсолютным биологическим правилом. Эффект зависит от локальной концентрации, типа клетки, стадии заболевания и активности сопряжённых путей.
Метаанализ 101 исследования, включивший 10 912 участников, выявил изменения отдельных показателей кинуренинового обмена при БДР, биполярном расстройстве и шизофрении. Вместе с тем значительная неоднородность результатов и пересечение распределений между пациентами и здоровыми людьми не позволяют использовать отношение кинуренин/триптофан как самостоятельный диагностический тест [26].
Микробные индолы
Кишечные бактерии превращают триптофан в индол, индол-3-молочную, индол-3-пропионовую, индол-3-уксусную кислоты и другие соединения. Часть из них активирует AhR и PXR, регулируя продукцию интерлейкина 22, слизистую защиту и плотные межклеточные контакты.
В эксперименте 2024 г. метаболические цепи, связанные с Parabacteroides distasonis, индол-3-альдегидом, индол-3-молочной кислотой и рецептором GPR35, изменяли стрессовое поведение и пластичность прилежащего ядра у животных [27]. В другой доклинической работе бифидобактерии с повышенной способностью образовывать индол-3-молочную кислоту уменьшали нейровоспалительные проявления [28]. Эти исследования подтверждают рецепторно-метаболическую правдоподобность, но не устанавливают эффективность приёма соответствующего метаболита у пациентов.
Почему кишечный серотонин не является серотонином мозга
Микробиота способна стимулировать продукцию серотонина энтерохромаффинными клетками кишечника [9]. Однако периферический серотонин практически не проходит через ГЭБ и не служит непосредственным источником серотонина центральной нервной системы. Он участвует в регуляции моторики кишечника, сосудистых и тромбоцитарных реакций, иммунных процессов и активности сенсорных окончаний.
На центральный серотонинергический обмен микробиота может влиять косвенно: изменяя доступность триптофана, активность кинуренинового пути, воспалительный фон, секрецию стрессовых гормонов и вагусную передачу. Поэтому утверждение «бактерии вырабатывают серотонин и направляют его в мозг» физиологически некорректно.
Пролин
Перспективный, но ещё не подтверждённый клинический посредник
Пролин участвует в синтезе коллагена, обмене глутамата, клеточном окислительно-восстановительном равновесии и реакциях, связанных с пирролин-5-карбоксилатом. Его концентрация определяется рационом, метаболизмом тканей, функцией печени и почек, состоянием внеклеточного матрикса и микробным потреблением.
J. Mayneris-Perxachs и соавторы объединили данные нескольких человеческих когорт, метагеномный и метаболомный анализ, эксперименты на мышах и дрозофилах. Повышенное потребление и циркулирующая концентрация пролина ассоциировались с более выраженными депрессивными симптомами; экспериментальное добавление пролина ухудшало отдельные поведенческие показатели у животных. Перенос человеческой микробиоты изменял экспрессию генов, связанных с ГАМК, пролиновым обменом и внеклеточным матриксом [29].
Эти результаты не доказывают, что стресс обязательно вызывает высвобождение пролина из тканей и что пролин непосредственно формирует тревожное расстройство. Человеческая часть работы остаётся преимущественно наблюдательной, а экспериментальные фенотипы не эквивалентны клинической депрессии.
Отдельное исследование F. Cathomas и соавторов выявило повышение матриксной металлопротеиназы 8 в крови пациентов с БДР и стресс-восприимчивых мышей. В животной модели миелоидная металлопротеиназа проникала в прилежащее ядро, изменяла внеклеточный матрикс и нейрофизиологические свойства ткани; её удаление уменьшало социальное избегание [30]. Эта работа подтверждает возможную связь периферического иммунитета, внеклеточного матрикса и стрессовой уязвимости, но не исследует пролин как непосредственного посредника.
Клинический вывод: валидированных пороговых концентраций пролина, диагностического теста или доказанного лечебного эффекта ограничения пролина в рационе не существует. Необоснованное исключение белковых продуктов может быть вредным, особенно для пожилых, беременных и пациентов с недостаточностью питания.
Желчные кислоты
Совместный продукт печени и микробиоты
Первичные желчные кислоты синтезируются в печени из холестерина и конъюгируются с глицином или таурином. Кишечные бактерии посредством гидролаз желчных солей, дегидрогеназ и реакций 7α-дегидроксилирования превращают их во вторичные кислоты. Следовательно, состав желчнокислотного пула определяется совместной активностью печени, кишечника и микробной экосистемы.
Желчные кислоты активируют ядерный рецептор FXR и мембранный рецептор TGR5, участвуют в регуляции фактора роста фибробластов 19, секреции глюкагоноподобного пептида 1, энергетического обмена, воспаления и барьерной функции. Некоторые соединения оказывают цитопротекторные эффекты, тогда как высокие концентрации гидрофобных желчных кислот способны повреждать клеточные мембраны.
В исследовании 208 нелеченных амбулаторных пациентов с БДР были выявлены различия сывороточных желчных кислот и их отношений; часть ассоциаций была выраженнее связана с тревожной симптоматикой, чем с общей тяжестью депрессии [31]. Однако анализ имел поисковый характер, включал большое число сравнений и не обеспечивал строгой защиты от ложноположительных результатов. Следовательно, эти данные следует рассматривать как основу для подтверждающих исследований, а не как клинический биомаркер.
Работа 2024 г. связала изменения микробиоты и желчнокислотного обмена с когнитивными нарушениями при БДР, объединяя наблюдения у людей и экспериментальные данные [32]. Она поддерживает гипотезу о влиянии микробно-модифицированных желчных кислот на когнитивные механизмы, но не доказывает, что изменение одного метаболита способно лечить депрессивный эпизод.
Утверждение о том, что бактериально преобразованные желчные кислоты непосредственно «управляют пластичностью гиппокампа» у человека, является более сильным, чем имеющиеся клинические доказательства. Данные о нейропластичности получены преимущественно в клеточных и животных моделях.
Моноамины, блуждающий нерв и иммунная передача сигнала
Некоторые микроорганизмы способны синтезировать или преобразовывать ГАМК, тирамин, дофаминоподобные и норадреналиноподобные соединения. Однако присутствие метаболита в просвете кишечника не означает его поступления в мозг. Между микробной клеткой и центральной нервной системой находятся кишечный эпителий, портальная циркуляция, печень, системный кровоток и ГЭБ.
Более обоснованы четыре непрямых механизма:
- изменение доступности аминокислот-предшественников;
- активация энтероэндокринных и энтеральных сенсорных клеток;
- регуляция цитокинов и клеток врождённого иммунитета;
- изменение активности афферентных волокон блуждающего нерва.
Блуждающий нерв передаёт не молекулы, а электрические сигналы, возникающие в ответ на сенсорную активацию кишечных структур. Эксперимент с L. rhamnosus JB-1 показал вагус-зависимый эффект конкретного штамма у мышей [7], но не позволяет заключить, что все пробиотики действуют тем же способом.
Иммунная цепь может включать активацию Toll-подобных рецепторов, продукцию интерлейкина 6, фактора некроза опухоли и интерферонов, индукцию индоламин-2,3-диоксигеназы и последующий сдвиг кинуренинового обмена. Вместе с тем нейровоспаление не является универсальной причиной БДР. У части пациентов воспалительные маркеры не повышены, а сходная симптоматика формируется через другие патофизиологические пути.
Многоуровневая модель действия
Молекулярный уровень | КЦЖК, индолы и желчные кислоты взаимодействуют с FFAR2/3, HCAR2, AhR, PXR, FXR, TGR5 и другими рецепторами. Дополнительным механизмом является регуляция гистондеацетилаз и экспрессии генов. Эти процессы связывают пищевые субстраты и микробную ферментацию с иммунной и метаболической сигнализацией. |
Клеточный уровень | Бутират поддерживает энергетический обмен колоноцитов; индольные метаболиты регулируют барьерные клетки; КЦЖК влияют на регуляторные T-лимфоциты; желчные кислоты взаимодействуют с энтероэндокринными и иммунными клетками. В центральной нервной системе микробиота-зависимые сигналы могут изменять состояние микроглии, клеточный окислительно-восстановительный обмен и структуру внеклеточного матрикса. |
Физиологический уровень | Нервный канал представлен энтеральной системой и блуждающим нервом; эндокринный — кортизолом, кишечными пептидами и метаболическими гормонами; иммунный — цитокинами и клеточными медиаторами; метаболический — триптофаном, кинуренинами, жирными и желчными кислотами. Эти системы действуют одновременно и способны взаимно усиливать или компенсировать друг друга. |
Патофизиологический уровень | Одна из возможных последовательностей включает снижение устойчивости микробной экосистемы, нарушение барьерной функции, системное низкоинтенсивное воспаление, активацию кинуренинового пути, изменение микроглии и нейропластичности. Альтернативная последовательность начинается с психологического стресса: кортизол и симпатическая нервная система изменяют моторику, секрецию слизи и кровоток кишечника, после чего формируется вторичный микробный профиль. |
Клинический уровень | Микробиота-зависимый компонент может быть особенно значим у части пациентов с сочетанием депрессивных симптомов, функциональных заболеваний кишечника, метаболического синдрома или воспалительного фенотипа. Однако такая комбинация не образует признанного самостоятельного диагноза и не отменяет стандартного психиатрического обследования. |
Популяционный уровень | Рацион, социально-экономические условия, ранние инфекции, антибиотики, урбанизация, хронический стресс и доступность медицинской помощи одновременно воздействуют на микробиоту и психическое здоровье. Поэтому популяционная ассоциация может отражать общий причинный фон, а не прямую цепь «микроорганизм — депрессия». |
Исследования у человека
Устойчивые сигналы без универсальной подписи
Систематический обзор и метаанализ исследований психических расстройств выявил повторяющиеся изменения отдельных микробных групп, но также показал значительное перекрытие профилей между диагнозами [10]. Это противоречит представлению о специфической для депрессии бактериальной конфигурации.
В обзоре 44 исследований, включавшем 2091 пациента с депрессивными расстройствами и 2792 участника контрольных групп, не было выявлено устойчивого различия общей внутривыборочной разнообразности. Для отдельных показателей неоднородность между исследованиями достигала 100%. Относительно чаще сообщалось о снижении некоторых бактерий, связанных с продукцией бутирата, и повышении отдельных потенциально провоспалительных таксонов, но результаты существенно зависели от региона, рациона, лекарств и способа лабораторного анализа [11].
В бельгийской когорте из 1054 человек с независимой проверкой результатов были выявлены связи Faecalibacterium и Coprococcus с показателями качества жизни. Coprococcus и Dialister реже обнаруживались у участников с депрессией после учёта антидепрессантов. Авторы также исследовали функциональный потенциал микробиоты, связанный с ГАМК и 3,4-дигидроксифенилуксусной кислотой, но не измеряли концентрацию дофамина непосредственно в мозге [12].
В Rotterdam Study анализ 1054 участников с проверкой результатов у 1539 человек выявил ассоциации депрессивных симптомов с 13 таксонами [13]. Несмотря на статистическую значимость, доля объясняемой вариабельности была невелика, а генетические инструменты для оценки причинности имели ограничения.
Эти исследования подтверждают существование групповых связей, но не позволяют диагностировать отдельного пациента по анализу кала. Разные микробные сообщества способны выполнять сходные метаболические функции, поэтому функциональная избыточность ослабляет воспроизводимость таксономических результатов.
Перенос микробиоты и проблема причинности
Перенос микробиоты от пациентов с депрессией стерильным или обработанным антибиотиками грызунам в ряде исследований сопровождался изменением предпочтения вознаграждения, социального поведения, обмена аминокислот и эндоканнабиноидной системы [14–16]. Такие эксперименты представляют более сильное доказательство потенциальной причинности, чем поперечные наблюдения у людей.
Однако причинный вывод ограничивают несколько обстоятельств. Донорские образцы нередко объединяются; животные получают стандартизованный рацион, отличающийся от питания доноров; степень приживления микробов неодинакова; антибиотическая подготовка сама изменяет иммунитет и метаболизм. Кроме того, поведенческие тесты оценивают отдельные компоненты мотивации или реакции на стресс, а не весь клинический синдром.
Систематический обзор 31 эксперимента по переносу человеческой микробиоты грызунам показал, что ни два исследования не использовали полностью идентичный протокол. Различались виды животных, подготовка кишечника, дозы, частота введения, способ объединения образцов, оценка приживления и поведенческие конечные точки [17]. Следовательно, воспроизводимость принципа выше, чем воспроизводимость конкретного микробного профиля.
Для убедительного доказательства роли конкретного метаболита необходимо последовательно показать, что:
- его изменение предшествует симптомам;
- вмешательство избирательно изменяет его концентрацию;
- изменение концентрации статистически опосредует клинический эффект;
- блокирование соответствующего рецептора устраняет эффект;
- результат воспроизводится в независимых человеческих выборках.
Для большинства обсуждаемых метаболитов выполнены отдельные звенья этой последовательности, но не вся цепь.
Диетические вмешательства
Польза вероятна, микробное посредничество не доказано
Рацион является наиболее физиологичным способом воздействия на микробную функцию. Пищевые волокна обеспечивают субстраты для ферментации, полифенолы подвергаются микробной биотрансформации, а разнообразие растительных продуктов способствует функциональному разнообразию экосистемы.
В исследовании SMILES индивидуальная программа улучшения рациона в течение 12 недель сопровождалась более выраженным уменьшением депрессивных симптомов, чем контрольное социальное сопровождение [40]. Исследование было сравнительно небольшим и не позволяло определить, какая часть эффекта была связана с микробиотой, а какая — с изменением питательной ценности рациона, массы тела, метаболического состояния, взаимодействия со специалистом и ожиданий участников.
Метаанализ пяти РКИ средиземноморского рациона, включивших 1507 участников, выявил уменьшение депрессивных симптомов со стандартизованной разностью средних около −0,53. Однако неоднородность составила 87,1%, а интервал прогноза для нового исследования пересекал отсутствие эффекта. Общая уверенность в доказательствах была низкой вследствие методологических ограничений и различий между вмешательствами [41].
Практически обоснован рацион с достаточным содержанием овощей, фруктов, бобовых, цельных злаков, орехов и источников ненасыщенных жиров при индивидуальном учёте переносимости и заболеваний желудочно-кишечного тракта. Такой подход оправдан общесоматической пользой, но не должен позиционироваться как самостоятельное лечение тяжёлой депрессии.
Пробиотики, пребиотики и синбиотики
Умеренный сигнал при высокой неоднородности
Метаанализ 2026 г. включил 70 РКИ продолжительностью от двух до 24 недель. Для депрессивных симптомов объединённая стандартизованная разность средних составила −0,57, для тревожных — −0,43. Неоднородность была высокой: 83,0 и 80,5% соответственно. Более крупные эффекты наблюдались в исследованиях с выборками менее 50 человек, что может указывать на нестабильность оценок и систематическую ошибку публикации. Авторы оценили общую уверенность как умеренную и рассматривали вмешательства только в качестве дополнения к стандартной терапии [34].
Отдельные исследования обеспечили важные механистические сигналы:
- в пилотном одноцентровом исследовании 49 пациентов многоштаммовый пробиотик оценивался как дополнение к антидепрессантам; основными задачами были переносимость, приемлемость и предварительная оценка величины эффекта, а не окончательное доказательство эффективности [35];
- четырёхнедельное исследование многоштаммового препарата показало более выраженное уменьшение отдельных клинических показателей и изменения нейровизуализационных характеристик, но число завершивших протокол было небольшим [36];
- Bifidobacterium breve CCFM1025 исследовалась в связи с метаболизмом триптофана и микробными изменениями [37];
- Lactobacillus plantarum 299v снижала концентрацию кинуренина и улучшала отдельные когнитивные показатели, но не продемонстрировала универсального антидепрессивного действия [38];
- в исследовании A. Kazemi и соавторов пробиотик улучшал баллы депрессии, тогда как отдельное пребиотическое вмешательство не показало сопоставимого результата [39].
Эти работы нельзя объединять как доказательство общего эффекта всех пробиотиков. Пробиотическое действие штаммоспецифично. Два штамма одного вида могут различаться по генам метаболизма, устойчивости к кислоте, продукции биогенных аминов и взаимодействию с иммунной системой.
Для клинически обоснованной рекомендации необходимы точная идентификация штамма, подтверждение дозы и жизнеспособности, стандартизованный состав, независимое воспроизведение эффекта и изучение безопасности. Указание только рода или вида бактерии недостаточно.
Постбиотики и очищенные метаболиты
Постбиотиками называют инактивированные микробные клетки, их структурные компоненты или стандартизованные продукты метаболизма, предназначенные для получения физиологического эффекта. Теоретически они могут быть лучше стандартизованы, чем живые микробные сообщества.
Однако для бутирата, индол-3-молочной кислоты, других индольных соединений и модификаторов желчнокислотного обмена остаются неясными оптимальная доза, фармакокинетика, тканевая доставка, длительность применения и возможные неблагоприятные эффекты. Крупных подтверждающих РКИ этих соединений как антидепрессантов нет.
Перспективность молекулы в клеточной культуре или у животных не означает готовности к клиническому применению. Особенно важна концентрационная зависимость: метаболит, физиологичный в просвете кишечника, при системном введении может действовать иначе.
Трансплантация фекальной микробиоты
Наиболее прямое, но пока экспериментальное вмешательство
ТФМ⁴ позволяет одновременно переносить сложное микробное сообщество и поэтому теоретически предоставляет наиболее прямую проверку причинной роли микробиоты. В психиатрии этот подход пока находится на ранней стадии.
Пилотное рандомизированное исследование включало 15 участников и сравнивало ректальное введение донорского материала с плацебо. Оно было предназначено прежде всего для оценки осуществимости, приемлемости и безопасности и не обладало достаточной статистической мощностью для оценки ремиссии [42].
В исследовании 2026 г. 46 пациентов были распределены в группы дополнительной ТФМ или лекарственного лечения. Краткосрочное наблюдение завершили 34 участника: 14 в экспериментальной и 20 в контрольной группе. Отсутствие процедурного плацебо, неполное ослепление, выраженное выбытие и двухнедельная продолжительность ограничивают достоверность полученного различия [43].
Наиболее строгое двойное слепое плацебо-контролируемое исследование включило 60 пациентов. Капсулы ТФМ или плацебо применялись в течение двух недель на фоне эсциталопрама; наблюдение продолжалось восемь недель. В группе ТФМ отмечалось большее снижение баллов HAMD-17 на второй и восьмой неделях, а молекулярный анализ выявил приживление части донорских штаммов, изменения желчных кислот и воспалительных сигналов. Однако первичная конечная точка — доля пациентов в ремиссии через восемь недель — статистически значимо между группами не различалась [44]. Анализ предполагаемых метаболических посредников носил преимущественно поисковый характер.
Следовательно, исследование [44] подтверждает биологическую активность вмешательства и возможность дальнейших испытаний, но не доказывает способность ТФМ вызывать ремиссию БДР.
Клинические рекомендации Американской гастроэнтерологической ассоциации рассматривают препараты на основе фекальной микробиоты главным образом при рецидивирующей инфекции Clostridioides difficile и отдельных заболеваниях желудочно-кишечного тракта, а не при депрессии [45]. Управление по контролю качества пищевых продуктов и лекарственных средств США предупреждало о передаче патогенных и множественно устойчивых микроорганизмов при ТФМ [46].
ТФМ при психических расстройствах должна проводиться только в рамках утверждённых клинических исследований. Самостоятельное или домашнее выполнение процедуры недопустимо.
Соотношение с доказанными методами лечения
Когнитивно-поведенческая терапия, поведенческая активация, интерперсональная психотерапия, антидепрессанты и комбинированные подходы располагают более развитой доказательной базой, чем микробиомные вмешательства.
Руководство NICE по лечению депрессии у взрослых предусматривает ступенчатый выбор психологического, лекарственного или комбинированного лечения с учётом тяжести состояния, предшествующего ответа, рисков и предпочтений пациента [47]. В январе 2026 г. была опубликована очередная оценка необходимости обновления рекомендаций; микробиомные процедуры не были включены в стандарт лечения депрессии.
Диета или пробиотик не должны задерживать обращение за психиатрической помощью при суицидальных мыслях, психотических симптомах, выраженной утрате функционирования, тяжёлой послеродовой депрессии или подозрении на биполярное расстройство.
Биомаркеры и лабораторная диагностика
Что измеряют современные методы
Исследование микробиоты может включать секвенирование гена 16S рибосомной РНК, полногеномное метагеномное секвенирование, метатранскриптомику, количественную полимеразную цепную реакцию, культивирование и метаболомный анализ.
Секвенирование 16S рРНК относительно доступно, но обычно обеспечивает ограниченное разрешение на уровне вида и не определяет функциональную активность. Полногеномное метагеномное секвенирование лучше выявляет виды, штаммы и гены, однако присутствие гена ещё не означает его экспрессию. Метатранскриптомика оценивает активную транскрипцию, а масс-спектрометрия измеряет метаболиты, но не всегда позволяет установить, образованы ли они микробами или тканями хозяина.
Преданалитические источники вариабельности
На результат влияют рацион в предшествующие дни, время сбора, температура и длительность хранения, консистенция кала, скорость кишечного транзита, антибиотики, ингибиторы протонной помпы, метформин, слабительные, психотропные препараты, курение и сопутствующие заболевания.
Различия в способах извлечения ДНК, последовательностях праймеров, глубине секвенирования и справочных базах способны создавать межлабораторную вариабельность, сопоставимую с предполагаемым биологическим эффектом. Рекомендации STORMS были разработаны для стандартизации отчётности и повышения воспроизводимости микробиомных исследований [48]. Общие принципы лабораторного и биоинформационного анализа систематизированы в работе R. Knight и соавторов [49].
Композиционная природа данных
Результаты секвенирования чаще выражаются в относительных долях. Если относительная доля одного микроорганизма увеличилась, это может быть следствием уменьшения другого при неизменном абсолютном количестве первого. Обычные статистические методы, не учитывающие композиционную структуру, создают ложные ассоциации [50].
Требования к клиническому тесту
Статистически значимая ассоциация не является достаточным основанием для диагностического применения. Биомаркер должен иметь заранее заданный порог, известную чувствительность и специфичность, воспроизводимость между лабораториями, внешнюю проверку и доказанную дополнительную ценность по сравнению с клиническим обследованием.
По состоянию на 27 июля 2026 г. ни микробный профиль кала, ни концентрации КЦЖК, индолов, пролина или желчных кислот не валидированы как самостоятельные клинические тесты для диагностики БДР или тревожного расстройства. Проспективное исследование 110 пациентов показало, что исходные микробные и метаболические признаки могут быть связаны с ответом на 12-недельное лечение эсциталопрамом [33], но результат требует независимого воспроизведения и не образует готовой прогностической системы.
Коммерческие заключения о «дефиците полезных бактерий», «нейромедиаторном потенциале микробиома» или необходимости персонализированного пробиотика обычно выходят за пределы клинически подтверждённых данных.
Особые группы пациентов
Дети и подростки | В детском и подростковом возрасте микробная экосистема, иммунитет и нервная система продолжают развиваться. Половое созревание, ранние инфекции, антибиотики, питание и семейная среда могут одновременно влиять на микробиоту и психическое состояние. Большинство клинических исследований микробиомных вмешательств проводилось у взрослых и не обладало достаточной статистической мощностью для возрастных подгрупп. |
Беременность и послеродовый период | Беременность сопровождается физиологическими изменениями гормонального, иммунного и желчнокислотного обмена. Безопасность живых микробных препаратов должна оцениваться для конкретного штамма и конкретной клинической ситуации. Экспериментальные микробиомные подходы не должны заменять доказанное лечение перинатальной депрессии. |
Пожилые пациенты | У пожилых людей микробиота зависит от мультиморбидности, полипрагмазии, питания, моторики кишечника, стоматологического состояния и уровня самостоятельности. Снижение разнообразия может отражать не биологическое старение как таковое, а недостаточное питание или функциональную слабость. Ограничительные диеты способны повышать риск белково-энергетической недостаточности. |
Иммунокомпрометированные пациенты | У пациентов с тяжёлой иммуносупрессией, повреждением кишечного барьера или центральными сосудистыми катетерами применение живых микроорганизмов требует повышенной осторожности. Для ТФМ критически необходимы стандартизованное обследование доноров и исключение патогенов и генов антибиотикорезистентности. |
Соматическая коморбидность | Синдром раздражённого кишечника, воспалительные заболевания кишечника, ожирение, сахарный диабет и заболевания печени одновременно связаны с изменением микробиоты и повышенной частотой депрессивных симптомов. Без учёта этих состояний микробный признак может ошибочно приписываться депрессии. |
Почему результаты исследований расходятся
Неоднородность клинического фенотипа | Одни работы включают пациентов с подтверждённым БДР, другие — людей с повышенным баллом самоопросника. Меланхолические, атипичные, тревожные, сезонные, перинатальные и биполярные депрессивные состояния могут иметь различную биологическую основу. |
Недостаточный размер выборок | Микробиомные исследования одновременно анализируют тысячи таксонов, генов и метаболитов. При небольшом числе участников статистическая мощность недостаточна, а вероятность случайных корреляций остаётся высокой даже после поправки на множественные сравнения. |
Остаточное смешение | Рацион, масса тела, лекарства, курение, физическая активность, сон, регион и социально-экономический статус связаны как с депрессией, так и с микробиотой. Статистическая поправка уменьшает, но не устраняет смешение. |
Обратная причинность | Депрессия изменяет аппетит, двигательную активность, суточный режим и кишечный транзит. Поэтому микробный профиль может быть следствием симптомов или лечения. |
Функциональная избыточность | Различные бактерии способны производить один и тот же метаболит. Таксономические результаты могут не воспроизводиться, хотя общий метаболический сдвиг остаётся сходным. |
Различие биологических сред | Кал преимущественно характеризует просвет толстой кишки и не полностью отражает слизистую оболочку или тонкий кишечник. Кал, плазма, моча и спинномозговая жидкость описывают разные этапы метаболического пути. |
Краткая продолжительность клинических исследований | Большинство испытаний пробиотиков продолжалось несколько недель. Этого может быть недостаточно для устойчивой перестройки экосистемы и оценки рецидивов, но достаточно для проявления неспецифических колебаний симптомов. |
Нарушение ослепления | Пробиотики, пребиотики и ТФМ способны изменять стул и желудочно-кишечные ощущения. Участник может предположить, в какую группу он включён, что увеличивает эффект ожидания. |
Систематическая ошибка публикации | Небольшие положительные исследования имеют больше шансов быть опубликованными, чем отрицательные. Более выраженные эффекты психобиотиков в малых выборках согласуются с этой возможностью [34]. |
Переобучение прогностических моделей | Высокая точность алгоритма машинного обучения внутри одной выборки может быть связана с утечкой данных, межсерийными лабораторными эффектами или чрезмерной подгонкой. Настоящая клиническая ценность требует проверки в независимой стране, лаборатории и временной когорте. |
Альтернативные объяснения
Общий причинный фон | Низкое качество рациона, нарушение сна, социальный стресс и хронические заболевания могут одновременно изменять микробиоту и повышать вероятность депрессии. В этой модели микробиота является индикатором неблагоприятной среды, а не главным посредником. |
Нисходящее управление | Первичным событием может быть центральная стрессовая дисрегуляция. Кортизол и симпатическая нервная система изменяют моторику, секрецию, кровоток и кислородный градиент кишечника, после чего формируется вторичная микробная перестройка. |
Метаболическая конвергенция | Различные сообщества приводят к сходному функциональному результату — например, снижению образования бутирата или изменению обмена триптофана. В этом случае поиск одной «бактерии депрессии» методологически ошибочен. |
Биологические подтипы | Микробиота может играть клинически значимую роль только у подгруппы пациентов — например, при сочетании депрессии с воспалением, метаболическим синдромом или заболеванием кишечника. Усреднение разных подтипов уменьшает наблюдаемый эффект. |
Эти объяснения не исключают друг друга. Наиболее реалистична сетевая модель, в которой микробиота в разных обстоятельствах выступает причиной, посредником, усилителем, следствием или сопутствующим маркером.
Научный консенсус и границы уверенности
Положения с высокой степенью согласия | Кишечные микроорганизмы образуют метаболиты, способные воздействовать на эпителиальные, иммунные, эндокринные и нервные процессы. Связь кишечника и мозга является двунаправленной. КЦЖК, производные триптофана и желчные кислоты представляют биологически значимые сигнальные молекулы. Депрессия на групповом уровне связана с изменениями микробного состава и функции. |
Вероятные, но не окончательно установленные положения | Микробный метаболизм способен изменять индивидуальный порог стрессовой восприимчивости. Воспалительно-метаболический подтип депрессии может быть особенно чувствителен к кишечным сигналам. Совместный анализ метагенома, метаболома и клинических характеристик может улучшить прогноз ответа на лечение. |
Положения, не подтверждённые клиническими доказательствами | Не доказано существование единого «здорового микробиома», универсальной бактерии депрессии или диагностического анализа кала. Не подтверждено, что кишечный серотонин непосредственно увеличивает серотонин мозга. Не установлено, что ограничение пролина лечит тревогу. Не доказано, что ТФМ повышает вероятность ремиссии БДР. Не существует оснований заменять пробиотиком психотерапию или антидепрессант. |
Направления дальнейших исследований
Следующий этап развития области должен быть направлен не на очередные небольшие поперечные сравнения, а на проверку причинных метаболических цепей.
Необходимы длительные проспективные когорты с повторным сбором образцов до эпизода, во время заболевания, после лечения и при рецидиве. Одновременно следует регистрировать рацион, лекарства, скорость кишечного транзита, сон, физическую активность, гормональные и воспалительные показатели.
Перспективно применение стабильных изотопов, позволяющих проследить путь субстрата от пищи через микробную реакцию к плазме и тканям. Полногеномное метагеномное секвенирование должно сочетаться с анализом транскриптов, белков и метаболитов.
Клинические испытания должны:
- заранее определять первичную конечную точку;
- иметь достаточную статистическую мощность;
- использовать стандартизованный препарат и плацебо;
- контролировать рацион, лекарства и кишечный транзит;
- оценивать не только баллы симптомов, но и ремиссию, функционирование, рецидив и качество жизни;
- проверять, опосредуется ли эффект изменением конкретного метаболита;
- проводить независимое воспроизведение результатов.
Наиболее перспективны строго охарактеризованные штаммы, синтетические микробные сообщества, стандартизованные постбиотики и персонализированные вмешательства для биологически определённых подгрупп пациентов.
Главные выводы
Кишечная микробиота является метаболическим преобразователем, а не автономным «вторым мозгом». Она превращает пищевые и эндогенные субстраты в сигналы, способные изменять барьерную функцию, иммунитет, эпигенетическую регуляцию, нейроэндокринный ответ и нейропластичность. Наиболее обоснованы механизмы, связанные с КЦЖК, кинуренинами, микробными индолами и желчными кислотами. Пролиновый и иммунно-матриксный пути перспективны, но требуют независимого подтверждения.
Микробиомные вмешательства не являются самостоятельным стандартом лечения депрессии или тревожных расстройств. Рацион с достаточным количеством разнообразной растительной пищи оправдан по совокупности общесоматических данных. Отдельные пробиотики и синбиотики могут давать умеренный дополнительный эффект, но результаты нельзя переносить на любой продукт. Клинический анализ микробиоты для диагностики депрессии не валидирован. ТФМ должна оставаться исследовательской процедурой.
Главная задача состоит в переходе от корреляции к причинному посредничеству: необходимо связать конкретную микробную функцию, измеренный метаболический поток, рецепторную мишень, физиологическое изменение и клинически значимый результат. Перспективнее искать не единую «бактерию настроения», а функциональные метаболические подтипы, при которых микробиота действительно становится терапевтически значимым звеном.
Бактерии кишечника не определяют настроение единолично, но могут изменять биологический контекст, в котором стресс либо компенсируется, либо способствует формированию клинической депрессии и тревоги.
¹ Микробиота — совокупность микроорганизмов определённой среды. Микробиом в строгом употреблении включает их генетический материал, функциональный потенциал и взаимодействие со средой. В литературе термины нередко используются взаимозаменяемо.
² Дисбиоз — описательный термин, обозначающий отличие микробного сообщества от выбранной группы сравнения. Он не является самостоятельным клиническим диагнозом и не имеет универсального лабораторного порога.
³ Депрессивноподобное поведение животных обозначает изменения отдельных экспериментальных показателей — например, предпочтения вознаграждения, социальной активности или реакции на неизбежный стресс. Оно не тождественно БДР человека.
⁴ Трансплантация фекальной микробиоты — перенос обработанного материала от обследованного донора. В психиатрии процедура не относится к стандартному лечению.
Список литературы и использованных источников
- Yuan M., Qin F., Wu L. [и др.] Gut microbiota-driven metabolites modulate the development of stress-related mental disorders // Translational Psychiatry. — 2026. — Опубликовано онлайн 19 июля 2026 г. — DOI: 10.1038/s41398-026-04154-8.
- World Health Organization. Depressive disorder (depression) [Электронный ресурс]. — Обновлено 29.08.2025. — Официальный сайт Всемирной организации здравоохранения. — Дата обращения: 27.07.2026.
- World Health Organization. Mental health at work [Электронный ресурс]. — Обновлено 02.09.2024. — Официальный сайт Всемирной организации здравоохранения. — Дата обращения: 27.07.2026.
- GBD 2019 Mental Disorders Collaborators. Global, regional, and national burden of 12 mental disorders in 204 countries and territories, 1990–2019: a systematic analysis for the Global Burden of Disease Study 2019 // The Lancet Psychiatry. — 2022. — Vol. 9, № 2. — P. 137–150. — DOI: 10.1016/S2215-0366(21)00395-3.
- Cryan J.F., O’Riordan K.J., Cowan C.S.M. [и др.] The microbiota-gut-brain axis // Physiological Reviews. — 2019. — Vol. 99, № 4. — P. 1877–2013. — DOI: 10.1152/physrev.00018.2018.
- Sudo N., Chida Y., Aiba Y. [и др.] Postnatal microbial colonization programs the hypothalamic-pituitary-adrenal system for stress response in mice // Journal of Physiology. — 2004. — Vol. 558, pt. 1. — P. 263–275. — DOI: 10.1113/jphysiol.2004.063388.
- Bravo J.A., Forsythe P., Chew M.V. [и др.] Ingestion of Lactobacillus strain regulates emotional behavior and central GABA receptor expression in a mouse via the vagus nerve // Proceedings of the National Academy of Sciences of the USA. — 2011. — Vol. 108, № 38. — P. 16050–16055. — DOI: 10.1073/pnas.1102999108.
- Kaelberer M.M., Buchanan K.L., Klein M.E. [и др.] A gut-brain neural circuit for nutrient sensory transduction // Science. — 2018. — Vol. 361, № 6408. — Art. eaat5236. — DOI: 10.1126/science.aat5236.
- Yano J.M., Yu K., Donaldson G.P. [и др.] Indigenous bacteria from the gut microbiota regulate host serotonin biosynthesis // Cell. — 2015. — Vol. 161, № 2. — P. 264–276. — DOI: 10.1016/j.cell.2015.02.047.
- Nikolova V.L., Smith M.R.B., Hall L.J. [и др.] Perturbations in gut microbiota composition in psychiatric disorders: a review and meta-analysis // JAMA Psychiatry. — 2021. — Vol. 78, № 12. — P. 1343–1354. — DOI: 10.1001/jamapsychiatry.2021.2573.
- Gao M., Wang J., Liu P. [и др.] Gut microbiota composition in depressive disorder: a systematic review, meta-analysis, and meta-regression // Translational Psychiatry. — 2023. — Vol. 13. — Статья 379. — DOI: 10.1038/s41398-023-02670-5.
- Valles-Colomer M., Falony G., Darzi Y. [и др.] The neuroactive potential of the human gut microbiota in quality of life and depression // Nature Microbiology. — 2019. — Vol. 4. — P. 623–632. — DOI: 10.1038/s41564-018-0337-x.
- Radjabzadeh D., Bosch J.A., Uitterlinden A.G. [и др.] Gut microbiome-wide association study of depressive symptoms // Nature Communications. — 2022. — Vol. 13. — Статья 7128. — DOI: 10.1038/s41467-022-34502-3.
- Zheng P., Zeng B., Zhou C. [и др.] Gut microbiome remodeling induces depressive-like behaviors through a pathway mediated by the host’s metabolism // Molecular Psychiatry. — 2016. — Vol. 21. — P. 786–796. — DOI: 10.1038/mp.2016.44.
- Kelly J.R., Borre Y., O’Brien C. [и др.] Transferring the blues: depression-associated gut microbiota induces neurobehavioural changes in the rat // Journal of Psychiatric Research. — 2016. — Vol. 82. — P. 109–118. — DOI: 10.1016/j.jpsychires.2016.07.019.
- Chevalier G., Siopi E., Guenin-Macé L. [и др.] Effect of gut microbiota on depressive-like behaviors in mice is mediated by the endocannabinoid system // Nature Communications. — 2020. — Vol. 11. — Статья 6363. — DOI: 10.1038/s41467-020-19931-2.
- D’Onofrio A.M., Gomez-Nguyen A., Camardese G. [и др.] Fecal microbiota transplantation from psychiatric patients to mice — systematic review of methodologies and a call for standardization // Translational Psychiatry. — 2026. — Vol. 16. — Статья 107. — DOI: 10.1038/s41398-026-03847-4.
- Koh A., De Vadder F., Kovatcheva-Datchary P., Bäckhed F. From dietary fiber to host physiology: short-chain fatty acids as key bacterial metabolites // Cell. — 2016. — Vol. 165, № 6. — P. 1332–1345. — DOI: 10.1016/j.cell.2016.05.041.
- Dalile B., Van Oudenhove L., Vervliet B., Verbeke K. The role of short-chain fatty acids in microbiota-gut-brain communication // Nature Reviews Gastroenterology & Hepatology. — 2019. — Vol. 16, № 8. — P. 461–478. — DOI: 10.1038/s41575-019-0157-3.
- Li J., Liu H., Wang M. [и др.] Alterations of short-chain fatty acids in depression and effects of probiotics/prebiotics interventions on levels and clinical symptoms: a systematic review and meta-analysis // BMC Psychiatry. — 2026. — Vol. 26. — Статья 446. — DOI: 10.1186/s12888-026-08097-8.
- Furusawa Y., Obata Y., Fukuda S. [и др.] Commensal microbe-derived butyrate induces the differentiation of colonic regulatory T cells // Nature. — 2013. — Vol. 504. — P. 446–450. — DOI: 10.1038/nature12721.
- Smith P.M., Howitt M.R., Panikov N. [и др.] The microbial metabolites, short-chain fatty acids, regulate colonic Treg cell homeostasis // Science. — 2013. — Vol. 341. — P. 569–573. — DOI: 10.1126/science.1241165.
- Braniste V., Al-Asmakh M., Kowal C. [и др.] The gut microbiota influences blood-brain barrier permeability in mice // Science Translational Medicine. — 2014. — Vol. 6, № 263. — Art. 263ra158. — DOI: 10.1126/scitranslmed.3009759.
- Erny D., Hrabě de Angelis A.L., Jaitin D. [и др.] Host microbiota constantly control maturation and function of microglia in the CNS // Nature Neuroscience. — 2015. — Vol. 18. — P. 965–977. — DOI: 10.1038/nn.4030.
- Cervenka I., Agudelo L.Z., Ruas J.L. Kynurenines: tryptophan’s metabolites in exercise, inflammation, and mental health // Science. — 2017. — Vol. 357, № 6349. — Art. eaaf9794. — DOI: 10.1126/science.aaf9794.
- Marx W., McGuinness A.J., Rocks T. [и др.] The kynurenine pathway in major depressive disorder, bipolar disorder, and schizophrenia: a meta-analysis of 101 studies // Molecular Psychiatry. — 2021. — Vol. 26. — P. 4158–4178. — DOI: 10.1038/s41380-020-00951-9.
- Cheng L. [и др.] A Gpr35-tuned gut microbe-brain metabolic axis regulates depressive-like behavior // Cell Host & Microbe. — 2024. — Vol. 32. — P. 227–243.e6. — DOI: 10.1016/j.chom.2023.12.009.
- Qian X. [и др.] Bifidobacteria with indole-3-lactic acid-producing capacity exhibit psychobiotic potential // Cell Reports Medicine. — 2024. — Vol. 5. — Статья 101798. — DOI: 10.1016/j.xcrm.2024.101798.
- Mayneris-Perxachs J., Castells-Nobau A., Arnoriaga-Rodríguez M. [и др.] Microbiota alterations in proline metabolism impact depression // Cell Metabolism. — 2022. — Vol. 34, № 5. — P. 681–701.e10. — DOI: 10.1016/j.cmet.2022.04.001.
- Cathomas F., Lin H.-Y., Chan K.L. [и др.] Circulating myeloid-derived MMP8 in stress susceptibility and depression // Nature. — 2024. — Vol. 626, № 8001. — P. 1108–1115. — DOI: 10.1038/s41586-023-07015-2.
- MahmoudianDehkordi S., Bhattacharyya S., Brydges C.R. [и др.] Gut microbiome-linked metabolites in the pathobiology of major depression with or without anxiety — a role for bile acids // Frontiers in Neuroscience. — 2022. — Vol. 16. — Статья 937906. — DOI: 10.3389/fnins.2022.937906.
- Jia M., Fan Y., Ma Q. [и др.] Gut microbiota dysbiosis promotes cognitive impairment via bile acid metabolism in major depressive disorder // Translational Psychiatry. — 2024. — Vol. 14. — Статья 503. — DOI: 10.1038/s41398-024-03211-4.
- Wang Y., Zhou J., Ye J. [и др.] Multi-omics reveal microbial determinants impacting the treatment outcome of antidepressants in major depressive disorder // Microbiome. — 2023. — Vol. 11. — Статья 195. — DOI: 10.1186/s40168-023-01635-6.
- Lian J., Yu W., Feng G., Miao D. Pre-/pro and synbiotics on anxiety and depression symptoms: a GRADE assessed systematic review and meta-analysis of randomized controlled trials // Annals of General Psychiatry. — 2026. — Vol. 25. — Статья 45. — DOI: 10.1186/s12991-026-00661-6.
- Nikolova V.L., Cleare A.J., Young A.H., Stone J.M. Acceptability, tolerability, and estimates of putative treatment effects of probiotics as adjunctive treatment in patients with depression: a randomized clinical trial // JAMA Psychiatry. — 2023. — Vol. 80, № 8. — P. 842–847. — DOI: 10.1001/jamapsychiatry.2023.1817.
- Schaub A.C., Schneider E., Vazquez-Castellanos J.F. [и др.] Clinical, gut microbial and neural effects of a probiotic add-on therapy in depressed patients: a randomized controlled trial // Translational Psychiatry. — 2022. — Vol. 12. — Статья 227. — DOI: 10.1038/s41398-022-01977-z.
- Tian P., Chen Y., Zhu H. [и др.] Bifidobacterium breve CCFM1025 attenuates major depression disorder via regulating gut microbiome and tryptophan metabolism: a randomized clinical trial // Brain, Behavior, and Immunity. — 2022. — Vol. 100. — P. 233–241. — DOI: 10.1016/j.bbi.2021.11.023.
- Rudzki L., Ostrowska L., Pawlak D. [и др.] Probiotic Lactobacillus plantarum 299v decreases kynurenine concentration and improves cognitive functions in patients with major depression: a double-blind, randomized, placebo-controlled study // Psychoneuroendocrinology. — 2019. — Vol. 100. — P. 213–222. — DOI: 10.1016/j.psyneuen.2018.10.010.
- Kazemi A., Noorbala A.A., Azam K. [и др.] Effect of probiotic and prebiotic vs placebo on psychological outcomes in patients with major depressive disorder: a randomized clinical trial // Clinical Nutrition. — 2019. — Vol. 38, № 2. — P. 522–528. — DOI: 10.1016/j.clnu.2018.04.010.
- Jacka F.N., O’Neil A., Opie R. [и др.] A randomised controlled trial of dietary improvement for adults with major depression: the SMILES trial // BMC Medicine. — 2017. — Vol. 15. — Статья 23. — DOI: 10.1186/s12916-017-0791-y.
- Bizzozero-Peroni B., Martínez-Vizcaíno V., Fernández-Rodríguez R. [и др.] The impact of the Mediterranean diet on alleviating depressive symptoms in adults: a systematic review and meta-analysis of randomized controlled trials // Nutrition Reviews. — 2025. — Vol. 83, № 1. — P. 29–39. — DOI: 10.1093/nutrit/nuad176.
- Green J.E., Berk M., Mohebbi M. [и др.] Feasibility, acceptability, and safety of faecal microbiota transplantation in the treatment of major depressive disorder: a pilot randomized controlled trial // Canadian Journal of Psychiatry. — 2023. — Vol. 68, № 5. — P. 315–326. — DOI: 10.1177/07067437221150508.
- Wang L., Zhang S., Liu Y. [и др.] A study on the efficacy and safety of fecal microbiota transplantation as an adjunctive therapy for treating depressive episodes // Scientific Reports. — 2026. — Vol. 16. — Статья 13417. — DOI: 10.1038/s41598-026-41801-y.
- Li J., Wang Y., Li R. [и др.] Adjunctive fecal microbiota transplantation for major depressive disorder: a randomized, double-blind, placebo-controlled trial // Cell Host & Microbe. — 2026. — Vol. 34, № 7. — P. 1367–1382.e7. — DOI: 10.1016/j.chom.2026.05.017.
- Peery A.F., Kelly C.R., Kao D. [и др.] AGA clinical practice guideline on fecal microbiota-based therapies for select gastrointestinal diseases // Gastroenterology. — 2024. — Vol. 166, № 3. — P. 409–434. — DOI: 10.1053/j.gastro.2024.01.008.
- U.S. Food and Drug Administration. Fecal microbiota for transplantation: safety alert — risk of serious adverse events likely due to transmission of pathogenic organisms [Электронный ресурс]. — 12.03.2020. — Официальный сайт Управления по контролю качества пищевых продуктов и лекарственных средств США. — Дата обращения: 27.07.2026.
- National Institute for Health and Care Excellence. Depression in adults: treatment and management. NICE guideline NG222 [Электронный ресурс]. — Опубликовано 29.06.2022; результаты внеочередной оценки актуальности опубликованы в январе 2026 г. — Официальный сайт NICE. — Дата обращения: 27.07.2026.
- Mirzayi C., Renson A., Genomic Standards Consortium [и др.] Reporting guidelines for human microbiome research: the STORMS checklist // Nature Medicine. — 2021. — Vol. 27. — P. 1885–1892. — DOI: 10.1038/s41591-021-01552-x.
- Knight R., Vrbanac A., Taylor B.C. [и др.] Best practices for analysing microbiomes // Nature Reviews Microbiology. — 2018. — Vol. 16. — P. 410–422. — DOI: 10.1038/s41579-018-0029-9.
- Gloor G.B., Macklaim J.M., Pawlowsky-Glahn V., Egozcue J.J. Microbiome datasets are compositional: and this is not optional // Frontiers in Microbiology. — 2017. — Vol. 8. — Статья 2224. — DOI: 10.3389/fmicb.2017.02224.

Кардиология
Инфектология
Онкология
Фертильность
Нефрология
Эндокринология